Структура управления ММ:

Во главе каждого Министерства находится министр магии, обладающий исполнительной, законодательной и судебной властью. Кроме премьер-министра магглов, о существовании Министерства магии не известно ни одному магглу. Министр магии представляется каждому новому премьер-министру магглов, периодически посещает его и информирует о событиях Магического Сообщества, которые в той или иной степени могут затронуть мир магглов.

Ниже министра по рангу находятся несколько его заместителей (самая известная из них - Долорес Амбридж), а также главы различных отделов Министерства. Руководящие чиновники обладают определённой степенью власти, однако она ограничивается властью действующего министра:

• Старший заместитель министра — пост, который занимала Долорес Амбридж до своего ареста за преступления против полукровок. Точная степень власти, которой обладает старший заместителя министра, неизвестна, однако тот факт, что ему позволено присутствовать на слушаниях Визенгамота наряду с министром и главой Отдела обеспечения магического правопорядка, позволяет предположить, что это очень высокая должность.
• Младший заместитель министра — пост, который занял Перси Уизли после окончания Хогвартса.
• Главы отделов. Эти сотрудники Министерства отвечают за деятельность подвластных им Отделов. Пост главы Отдела обеспечения магического правопорядка кажется самым главным и самым престижным, так как является одним из основных компонентов порядка преемственности должности министра.

Отделы (департаменты) ММ:

Отдел обеспечения магического правопорядка.

Самое главное из всех подразделений Министерства, представляет собой объединение полиции и органов правосудия. Когда-то Отдел возглавлял Бартемий Крауч старший. На протяжении событий последней книги главой Отдела был Пожиратель смерти Яксли, занявший место Пия Толстоватого, который в свою очередь получил эту должность после жестокой смерти Амелии Боунс от руки Волан-де-Морта.

Отдел обеспечения магического правопорядка включает в себя следующие подразделения:

• Штаб-квартира мракоборцев (англ. aurors): подразделение Отдела обеспечения магического правопорядка Министерства Магии в вымышленном мире Гарри Поттера. Представляет собой штаб-квартиру мракоборцев — волшебников, занимающихся борьбой с тёмными магами.
• Группа обеспечения магического правопорядка — подразделение, занимающееся выявлением случаев нарушения закона.
• Сектор выявления и конфискации поддельных защитных заклинаний и оберегов -  Очевидно, когда Руфус Скримджер занял пост Министра магии, из-за угрозы Лорда Волан-де-Морта Магическому Сообществу появилось несколько новых подразделений, необходимых в условиях войны, этот сектор в их числе.
• Сектор борьбы с незаконным использованием изобретений маглов- В обязанности сотрудников данного сектора входит регулирование применения магии к предметам, созданным маглами, а также выявление таких предметов.
• Сектор борьбы с неправомерным использованием магии - Устанавливает наказание волшебникам за неуместное использование магии, за колдовство в неподходящее время или с нарушением магических законов. Это подразделение отвечает за расследование нарушений Декрета о разумном ограничении волшебства несовершеннолетних и Статута о секретности Международной конфедерации магов. Декрет регламентирует использование магии несовершеннолетними волшебниками и колдуньями, в то время как Статут о секретности запрещает волшебникам использовать магию в присутствии маглов или в маглонаселённых районах. Как только в Отдел поступает информация о нарушении Декрета, нарушителю поступает сообщение, в котором сообщается, какие меры будут предприняты Отделом. Как правило, волшебника, замеченного в нарушении первый раз, отпускают с предупреждением, в то время как в чрезвычайных ситуациях Сектор борьбы с неправомерным использованием магии предпринимает более серьёзные меры наказания.
• Административные службы Визенгамота — Верховного суда правосудия волшебников.

Отдел магических происшествий и катастроф

Этот отдел отвечает за устранение вреда, нанесённого случайным волшебством. Включает в себя следующие подразделения:

• Группа аннулирования случайного волшебства- Это группа волшебников, обязанностью которых является устранение последствий «случайного волшебства», как то магия детей, ещё не умеющих контролировать свои способности, или магия взрослых волшебников, не подчиняющихся закону. Сюда же относятся «побочные» эффекты некоторых заклинаний, вызванные непреднамеренно, например, «расщеп» при трансгрессии.
• Штаб-квартира стирателей памяти - Стиратели памяти — это сотрудники Министерства магии, обязанностью которых является изменение памяти маглов, ставших свидетелями событий магического происхождения.
• Комитет по выработке объяснений для маглов - Данное подразделение занимается выработкой объяснений магических происшествий, которые не могут быть исправлены с помощью магии или воспоминания о которых не могут быть полностью удалены из памяти маглов. Также Комитет создаёт объяснения происшествиям, которым сами маглы не могут дать объяснения.

Отдел регулирования магических популяций и контроля над ними

Отдел занимается вопросами, связанными с различными магическими существами. Например, в шестой книге Корнелиус Фадж упоминает о том, что именно этот Отдел контролирует перевозку драконов и сфинкса для Турнира Трёх Волшебников.
В состав Отдела входят Управление по связям с гоблинами и кентаврами. Однако кентавры, предпочитая не иметь с волшебниками никаких дел, ни разу не связывались с этим Управлением с момента его основания. Поэтому в Министерстве фраза «быть переведённым в Управление по связям с кентаврами» означает, что волшебника собираются уволить.

Отдел включает в себя следующие подразделения:
• Подразделение зверей
• Подразделение существ
• Подразделение духов
• Управление по связям с гоблинами
• Консультационное бюро по борьбе с вредителями

Отдел международного магического сотрудничества

Основной целью Отдела является налаживание международных контактов и привлечение волшебников всех стран к сотрудничеству. По характеру своей деятельности Отдел международного магического сотрудничества схож с «магловским» британским Министерством иностранных дел и по делам Содружества, с той лишь разницей, что в мире волшебников нет эквивалента понятию «Содружество», и Отдел создан с целью обеспечения сотрудничества магов, в то время как его «магловский» аналог не преследует таких возвышенных целей.

Отдел международного магического сотрудничества включает в себя:

• Международный совет по выработке торговых стандартов
• Международное бюро магического законодательства
• Британский филиал Международной конфедерации магов - Международная конфедерация магов имеет много обязанностей, в частности, поддержание международного Статута о секретности. Из книг неизвестно, какой степенью власти обладает конфедерация магов, хотя, возможно, она является магическим аналогом ООН, призванным объединить все Министерства магии в мире. Известно, что конфедерация была создана в 1692 году. Именно в это время были проведены многочисленные важные законы, такие как, например, установление права волшебников на волшебные палочки. Возможно, конфедерация магов была вовлечена в противостояние Магического Сообщества и маглов во времена гонения волшебников.

Отдел магического транспорта

Этот отдел отвечает за различные вопросы, связанные с магическим транспортом и включает в себя следующие подразделения:

• Руководящий центр Сети летучего пороха Подразделение отвечает за установку и поддержание Сети каминов, а также за распространение летучего пороха. Сеть летучего пороха состоит из каминов, находящихся во всех волшебных домах, связанных между собой. Сеть позволяет перемещаться из одного камина в другой благодаря магическим свойствам летучего пороха.
• Сектор контроля за мётлами
• Портальное управление
• Трансгрессионый испытательный центр - Является магическим аналогом Агентства по лицензированию водителей и транспортных средств Соединённого Королевства. В этом центре выдаются лицензии волшебникам и колдуньям на право трансгрессии.

Отдел магических игр и спорта

Одной из обязанностей Отдела является организация таких спортивных мероприятий как Чемпионат мира по квиддичу и Турнир Трёх Волшебников. Некоторое время главой Отдела был Людо Бэгмен, питающий страсть к азартным играм. Кто возглавляет Отдел в настоящее время, неизвестно.

В состав Отдела магических игр и спорта входят следующие подразделения:

• Штаб-квартира Британско-ирландской лиги квиддича
• Официальный клуб игроков в плюй-камни
• Сектор патентов на волшебные шутки

Отдел тайн

Отдел тайн занимается изучением различных загадок, но практически вся работа Отдела засекречена. Немногие сотрудники Министерства знают, что на самом деле находится в этом Отделе. Волшебников, работающих в Отделе тайн, называют невыразимцами. Друг Артура Уизли, Бродерик Боуд, работает невыразимцем. Августус Руквуд, шпион и Пожиратель смерти, также работал невыразимцем до своего ареста. Так как деятельность Отдела тайн является засекреченной, это подразделение Министерства магии напоминает реально существующие ЦРУ и СИС, работа которых также держится в строгой секретности от простого населения. Однако сотрудники Отдела тайн скорее являются учёными, стремящимися постичь источники и законы магии.

Несмотря на то, что конкретная деятельность Отдела тайн неизвестна, некоторые детали всё же даются в пятой книге «Гарри Поттер и Орден Феникса». Так, очевидно, Отдел работает над разгадкой тайн смерти, времени, мыслей и любви, а также записывает и хранит все когда-либо сделанные пророчества.